Prof. Leonardo M. Cruz

orcid.org/0000-0002-1380-576X

Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular

Setor de Ciências Biológicas

Universidade Federal do Paraná

 Minicurso EPB 2024

Bioinformática aplicada a análise de microbiomas com dados de sequências amplicon

Apresentação

Minicurso oferecido por ocasião da edição 2024 da Escola Paranaense de Bioinformática (EPB), realizada no Centro de Ciências Biológicas (CCB) da Universidade Estadual de Londrina (UEL), nos os dias 6, 7 e 8 de novembro.

Carga horária: 8h
Data: 30 de outubro de 2024
Aulas: remotas síncronas
   08:00h às 12:00h
   13:00h às 17:00h
Sala virtual Google: https://classroom.google.com/c/NzI0MTk3NTI4NDg0

Tópicos abordados

Apresentação

1. Introdução
2. Análise de qualidade dos dados
3. Análise de agrupamento de sequências
4. Análise filogenética para classificação de dados de microbioma
5. Medidas de alfa e beta diversidade
6. Identificação taxonômica a partir de sequências
7. Análise de abundância diferencial

Pré-requisitos

• Conhecimento básico em Biologia Molecular
• Bioinformática básica
• Comandos Linux básico

Público alvo

Alunos de graduação e pós-graduação

Última atualização: 29 de outubro de 2024