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Classificação dos bancos
de dados biológicos
- Dados primários ou derivados
- Primário
- Resultados experimentais são diretamente armazenados no banco de dados
- GenBank, ENA, EMBL e DDBJ (sequências de nucleotídios)
- ArrayExpressArchive e GEO (genômica funcional)
- PDB (estruturas de macromoléculas)
- Secundário
- Resultado de análises de bancos de dados primários
- UniProtKB (sequências e informação funcional de proteínas)
- Pfam, InterPro, PROSITE (famílias de rpoteínas, motivos e domínios)
- Especializado
- Ex., molécula específica (Ribosomal Database Project), organismo particular (genomas eucarióticos)
- OBS. Alguns bancos de dados apresentam características em mais de uma categoria e a classificação pode variar
- Design técnico
- Flat-files
- Bancos de dados relacionais (SQL)
- Bancos de dados orientado a objetos
- Tecnologias de troca/publicação
- FTP, HTML, COBRA, XML, SOAP