RELAB - Curso de Biologia Molecular e Genômica (2020.1)


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Quadro de Aviso





MÓDULO DE BIOINFORMÁTICA

Professores

Leonardo M. Cruz | Depto. de Bioquímica e Biologia Molecular - UFPR
Vinícius Almir Weiss - UFPR

Local

Aulas teóricas e práticas: Laboratório de Informática do Setor de Educação Profissional e Tecnológica (SEPT)

Bibliografia recomendada

  1. ZAHA, A.; FERREIRA, H. B.; PASSAGLIA, L. M. Biologia molecular Básica. 4a Ed. Artmed Editora, Porto Alegre, 2011
  2. LESK, A. M. Introdução à Bioinformática. 2a ed. Artmed, Porto Alegre, 384p. 2008.
  3. VERLI, H. (org.) Bioinformática - da Biologia à Flexibilidade molecular. 1a ed. Porto Alegre, 282p. 2014. Distribuição digital gratuita: http://www.ufrgs.br/bioinfo/ebook/
  4. BROWN, T. A. Clonagem Gênica e Análise de DNA. 4a ed. Artmed, Porto Alegre. 2003
  5. MOREIRA, L. M. (organizador). Ciências genômicas - fundamentos e aplicações. Ribeirão Preto: Sociedade brasileira de genética. 403p., 2015 Distribuição digital gratuita: pdf file

Material de apoio

Programas para análise Bioinformática

BioEdit v7.2.5 | Página oficial | Baixar

Quinta, dia 23/01/2020

08:30h - 10:30h | Aula 9
           O que é Bioinformática, alinhamento de sequências biológicas e bancos de dados presentation
           Aplicação da Bioinformática ao estudo de genomas presentation
           Técnicas de sequenciamento de DNA presentation
Material complementar: Illumina video file | Ion Torrent video file | PacBio video file | Nanopore video file
11:00h - 12:30h |
14:00h - 18:00h | Trabalho prático 4
                              Explorando bancos de dados biológicos
                              Análise de sequência de dinossouro pdf file
                              Montagem de sequência contígua e anotação pdf file | dataset1e2.fas


Sexta, dia 24/01/2020

08:30h - 10:30h | Aula 10
Transcriptômica, proteômica e metagenômica presentation
Filogenia e evolução molecular presentation
11:00h - 12:30h | Trabalho prático 5
                              Identificação taxonômica e filogenia de bactérias pdf file
                              Identificação taxonômica de sequências metagenômica | conjunto de dados
                              Análise metagenômica no MetaComet